Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RTKNQ9BST9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RTKNQ9BST9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms