Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RBBP8Q99708 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms