Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3R4Q99570 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3R4Q99570 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms