Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NSMCE2Q96MF7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms