Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP47Q96K76 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP47Q96K76 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms