Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC45A3Q96JT2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC45A3Q96JT2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC45A3Q96JT2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC45A3Q96JT2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC45A3Q96JT2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC45A3Q96JT2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC45A3Q96JT2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms