Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RUNDC1Q96C34 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 833 ms