Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms