Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCG3Q8WXD2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCG3Q8WXD2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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