Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms