Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CNIH3Q8TBE1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CNIH3Q8TBE1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CNIH3Q8TBE1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CNIH3Q8TBE1 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CNIH3Q8TBE1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CNIH3Q8TBE1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CNIH3Q8TBE1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CNIH3Q8TBE1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CNIH3Q8TBE1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CNIH3Q8TBE1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CNIH3Q8TBE1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CNIH3Q8TBE1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CNIH3Q8TBE1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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