Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CLDN19Q8N6F1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CLDN19Q8N6F1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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CLDN19Q8N6F1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CLDN19Q8N6F1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CLDN19Q8N6F1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CLDN19Q8N6F1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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CLDN19Q8N6F1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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CLDN19Q8N6F1 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CLDN19Q8N6F1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN19Q8N6F1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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