Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KCNMB4Q86W47 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms