Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATG4DQ86TL0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms