Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
BRINP3Q76B58 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRINP3Q76B58 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRINP3Q76B58 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRINP3Q76B58 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRINP3Q76B58 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRINP3Q76B58 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRINP3Q76B58 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRINP3Q76B58 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRINP3Q76B58 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRINP3Q76B58 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BRINP3Q76B58 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BRINP3Q76B58 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BRINP3Q76B58 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms