Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP31Q70CQ4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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