Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWH4

FAM198B, Protein FAM198B, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM198BQ6UWH4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FAM198BQ6UWH4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms