Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAF7Q6Q0C0 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms