Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPX1

TBC1D3C, TBC1 domain family member 3C, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D3CQ6IPX1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TBC1D3CQ6IPX1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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