Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARMIL2Q6F5E8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms