Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HES3Q5TGS1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms