Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMPD1Q5SYB0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms