Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C10orf55Q5SWW7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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