Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PCID2Q5JVF3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms