Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRRT3Q5FWE3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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