Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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C4orf17Q53FE4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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C4orf17Q53FE4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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C4orf17Q53FE4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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C4orf17Q53FE4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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C4orf17Q53FE4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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C4orf17Q53FE4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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C4orf17Q53FE4 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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C4orf17Q53FE4 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
C4orf17Q53FE4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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