Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms