Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZIK1Q3SY52 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms