Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SPHKAPQ2M3C7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHKAPQ2M3C7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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