Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CSPP1Q1MSJ5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CSPP1Q1MSJ5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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