Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HADHQ16836 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HADHQ16836 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HADHQ16836 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HADHQ16836 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HADHQ16836 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HADHQ16836 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HADHQ16836 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HADHQ16836 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HADHQ16836 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HADHQ16836 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HADHQ16836 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HADHQ16836 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HADHQ16836 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HADHQ16836 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HADHQ16836 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HADHQ16836 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HADHQ16836 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HADHQ16836 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HADHQ16836 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HADHQ16836 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HADHQ16836 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HADHQ16836 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HADHQ16836 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HADHQ16836 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HADHQ16836 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HADHQ16836 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HADHQ16836 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HADHQ16836 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HADHQ16836 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HADHQ16836 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HADHQ16836 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HADHQ16836 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HADHQ16836 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HADHQ16836 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HADHQ16836 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HADHQ16836 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HADHQ16836 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HADHQ16836 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HADHQ16836 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HADHQ16836 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HADHQ16836 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HADHQ16836 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HADHQ16836 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms