Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLPPQ16740 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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