Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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ECM1Q16610 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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ECM1Q16610 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECM1Q16610 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
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