Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLFQ16534 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLFQ16534 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLFQ16534 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLFQ16534 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLFQ16534 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HLFQ16534 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HLFQ16534 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HLFQ16534 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HLFQ16534 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLFQ16534 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLFQ16534 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HLFQ16534 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms