Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC6Q16204 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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