Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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