Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB39AQ14964 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms