Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SMC1AQ14683 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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