Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CKAP5Q14008 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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