Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ITGA9Q13797 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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