Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PMS2P11Q13670 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms