Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HDAC1Q13547 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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