Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EIF4EBP1Q13541 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms