Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHAF1AQ13111 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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