Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SMARCB1Q12824 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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SMARCB1Q12824 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMARCB1Q12824 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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