Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms