Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP160Q12769 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP160Q12769 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms