Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CGNL1Q0VF96 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGNL1Q0VF96 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms