Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TGM3Q08188 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms