Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TFF3Q07654 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TFF3Q07654 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TFF3Q07654 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TFF3Q07654 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TFF3Q07654 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TFF3Q07654 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TFF3Q07654 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TFF3Q07654 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms